More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0309 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  86.56 
 
 		 439 aa  778    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  79.95 
 
 		 439 aa  720    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  86.56 
 
 		 439 aa  778    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 438 aa  894    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  64.45 
 
 		 440 aa  567  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  53.88 
 
 		 448 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 411 aa  131  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  31.01 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  30.31 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 444 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 419 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 421 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 513 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 464 aa  93.6  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 439 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 423 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  28.49 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.06 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.05 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  22.47 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.5 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.82 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.57 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 410 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.64 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.84 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.84 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.84 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.84 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.47 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.78 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  23.48 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.61 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4379  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5060  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5800  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 536 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.01 
 
 		 496 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  23.77 
 
 		 487 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.9 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>