More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4989 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  90.57 
 
 		 435 aa  832    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 436 aa  898    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  43.96 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  43.05 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  42.31 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  42.69 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.05 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 536 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 439 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  29.49 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  31.38 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.87 
 
 		 439 aa  87  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.11 
 
 		 439 aa  86.7  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.92 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.92 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.58 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  31.62 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  25.47 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3735  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.22 
 
 		 590 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1742  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.32 
 
 		 590 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.77 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1445  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 579 aa  73.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779886  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  24 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5939  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 610 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.69 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1357  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000953949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1533  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.219593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009665  Shew185_3021  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 487 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3164  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.625995  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3006  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.77 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4889  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  30.22 
 
 		 596 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3630  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 580 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1367  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 595 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2670  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00030492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4211  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.64235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3982  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 573 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.227864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3127  sugar ABC transporter  24.07 
 
 		 579 aa  67.4  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 411 aa  67  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.33 
 
 		 411 aa  67  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5703  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.94 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2227  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  29.51 
 
 		 580 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272484  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6464  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  32.03 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9075  hypothetical protein  32.88 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2909  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0100  hypothetical protein  32.61 
 
 		 574 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0356789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.04 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2756  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>