More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2696 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 498 aa  1025    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 449 aa  146  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  28.35 
 
 		 487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  27.92 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  28.47 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  28.73 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 442 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 444 aa  118  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 536 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.02 
 
 		 422 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.78 
 
 		 422 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  24.2 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.24 
 
 		 421 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 432 aa  100  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 449 aa  97.8  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  24.18 
 
 		 426 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.18 
 
 		 426 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.18 
 
 		 426 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.18 
 
 		 426 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  24.95 
 
 		 447 aa  97.1  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.18 
 
 		 426 aa  97.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.18 
 
 		 426 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2488  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 495 aa  96.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.56273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.3 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2011  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 480 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.95 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.22 
 
 		 423 aa  94.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 470 aa  93.6  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 439 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 436 aa  90.5  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2164  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 438 aa  88.6  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.94 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7451  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2539  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.89 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 412 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.21 
 
 		 496 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 439 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4078  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 439 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4379  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.7 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5060  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5800  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  26.55 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0900  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0889  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2566  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4037  ABC sugar transporter, periplasmic lignad binding protein  28.11 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0204263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.89 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3225  putative sugar ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  24.36 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0178955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  25.51 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4090  twin-arginine translocation pathway signal  23.48 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.25614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.44 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3333  transporter, putative  25.38 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4400  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>