More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0623 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
428 aa  876    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  87.59 
 
 
428 aa  756    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  67.45 
 
 
434 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  46.75 
 
 
426 aa  358  7e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  44.5 
 
 
419 aa  334  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  43.84 
 
 
418 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  39.84 
 
 
428 aa  274  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  36.82 
 
 
437 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  34.67 
 
 
425 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  34.39 
 
 
455 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 
453 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 
439 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  34.53 
 
 
446 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 
436 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  33.5 
 
 
448 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 
414 aa  202  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  33.24 
 
 
411 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  33.24 
 
 
411 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  33.16 
 
 
436 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.88 
 
 
424 aa  189  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  36.73 
 
 
522 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  35.16 
 
 
439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  35.45 
 
 
419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  34.7 
 
 
423 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 
447 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  31.54 
 
 
420 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  34.05 
 
 
433 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 
440 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  33.06 
 
 
430 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  32.54 
 
 
416 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  34.28 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  29.75 
 
 
438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  31.23 
 
 
466 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  32.26 
 
 
464 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
422 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  34.35 
 
 
400 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 
411 aa  170  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 
423 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 
423 aa  169  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 
421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 
420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.26 
 
 
421 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.4 
 
 
454 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 
423 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 
421 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 
465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 
465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 
465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
464 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  28.82 
 
 
421 aa  143  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
425 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.62 
 
 
521 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  29.36 
 
 
422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  28.46 
 
 
468 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.68 
 
 
402 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  29.07 
 
 
433 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 
412 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 
412 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
449 aa  122  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 
724 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 
437 aa  116  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
464 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 
415 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
416 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
483 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
386 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 
419 aa  106  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 
441 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 
431 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
444 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 
447 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
444 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.75 
 
 
439 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.07 
 
 
436 aa  97.8  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.4 
 
 
434 aa  97.4  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.45 
 
 
439 aa  97.1  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 
437 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 
387 aa  96.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 
408 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
424 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 
427 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 
411 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.93 
 
 
426 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
430 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.85 
 
 
496 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 
514 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 
412 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>