More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1331 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
464 aa  948    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  59.65 
 
 
466 aa  479  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 
428 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  40.25 
 
 
414 aa  236  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  33.03 
 
 
437 aa  229  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 
411 aa  223  7e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 
411 aa  223  8e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 
425 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  34.81 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  36.9 
 
 
411 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  35.88 
 
 
436 aa  213  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  37.13 
 
 
421 aa  209  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  35.7 
 
 
413 aa  208  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  33.82 
 
 
446 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  33.25 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  34.69 
 
 
423 aa  194  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  31.77 
 
 
430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  30.91 
 
 
421 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  31.48 
 
 
440 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  32.01 
 
 
422 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 
424 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 
422 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.58 
 
 
421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.05 
 
 
424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  34.08 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 
428 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  33.15 
 
 
433 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  31.66 
 
 
438 aa  169  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 
423 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 
421 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  31.13 
 
 
434 aa  167  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.61 
 
 
418 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  33.87 
 
 
419 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  34.13 
 
 
522 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
428 aa  162  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 
447 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 
420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 
425 aa  156  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 
412 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  31.72 
 
 
412 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 
412 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
416 aa  147  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
419 aa  146  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 
418 aa  146  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
363 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 
436 aa  143  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 
437 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  33.23 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  28.84 
 
 
426 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.79 
 
 
431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
444 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.96 
 
 
426 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 
449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
424 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
465 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 
416 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 
426 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
465 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
465 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 
514 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 
511 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 
431 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 
420 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
424 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 
433 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.95 
 
 
460 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.3 
 
 
402 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
419 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 
724 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
448 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.14 
 
 
521 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.02 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 
456 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
411 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 
433 aa  98.2  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
446 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.2 
 
 
399 aa  95.1  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  31.2 
 
 
426 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.87 
 
 
496 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  32.74 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.2 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.2 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.2 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.2 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  32.9 
 
 
438 aa  94  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 
428 aa  93.6  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.8 
 
 
426 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>