More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3240 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  86.54 
 
 
419 aa  764    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
431 aa  879    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  58.81 
 
 
412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  58.81 
 
 
439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  58.81 
 
 
439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  58.29 
 
 
496 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  55.5 
 
 
412 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  56.76 
 
 
446 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4399  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 
455 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0609802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  30.41 
 
 
438 aa  143  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.49 
 
 
422 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.49 
 
 
422 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
422 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 
437 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 
424 aa  136  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
414 aa  136  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 
440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 
411 aa  124  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 
419 aa  123  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 
433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
444 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 
416 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 
452 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.71 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.25 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
449 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
363 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.41 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
439 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
449 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 
466 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
413 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 
432 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
428 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 
439 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 
419 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
447 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
412 aa  106  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.49 
 
 
433 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
423 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 
464 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 
428 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 
428 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
423 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 
410 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  24.48 
 
 
447 aa  104  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
447 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
443 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
421 aa  103  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
418 aa  103  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 
423 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.67 
 
 
426 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  28.67 
 
 
426 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
436 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 
412 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.67 
 
 
426 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.67 
 
 
426 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.67 
 
 
426 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.67 
 
 
426 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 
484 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.42 
 
 
399 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
443 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.97 
 
 
423 aa  99.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 
425 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
428 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
435 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.59 
 
 
426 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.54 
 
 
431 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 
439 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 
448 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 
408 aa  97.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
435 aa  97.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 
412 aa  96.7  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
397 aa  97.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
724 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 
436 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 
412 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
444 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.07 
 
 
421 aa  96.3  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  28.17 
 
 
468 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 
430 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 
486 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  24.61 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
455 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.62 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.04 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 
436 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.44 
 
 
438 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
438 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
453 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 
498 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>