More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0950 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  100 
 
 
438 aa  878    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  45.92 
 
 
440 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  43.38 
 
 
422 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  42.89 
 
 
433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  41.69 
 
 
421 aa  299  7e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  33.87 
 
 
428 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 
411 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 
411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 
411 aa  218  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 
414 aa  218  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  37.66 
 
 
447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  32.2 
 
 
437 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
425 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  33.88 
 
 
423 aa  202  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
421 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  34.54 
 
 
419 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  31.77 
 
 
423 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  33.7 
 
 
439 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 
439 aa  180  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  30.94 
 
 
428 aa  176  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 
434 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  31.51 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 
428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 
422 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 
420 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.4 
 
 
424 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  31.04 
 
 
424 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 
430 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 
421 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 
425 aa  167  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 
466 aa  166  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  31.48 
 
 
446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 
421 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.18 
 
 
421 aa  157  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  31.78 
 
 
522 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  31.91 
 
 
419 aa  153  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
423 aa  152  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
412 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
453 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 
420 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  30.14 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 
419 aa  146  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.97 
 
 
418 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 
412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  30.37 
 
 
436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
416 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.45 
 
 
402 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 
412 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 
448 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 
433 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 
412 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
423 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  29.75 
 
 
468 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  29.28 
 
 
416 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 
412 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 
412 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 
439 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 
439 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.27 
 
 
496 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 
418 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 
400 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
363 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 
419 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
444 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.34 
 
 
426 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
424 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 
411 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 
458 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
441 aa  99.8  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
415 aa  96.7  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.17 
 
 
454 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.46 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.91 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 
432 aa  93.6  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
437 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
455 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
455 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 
435 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 
430 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
436 aa  91.3  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 
449 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 
483 aa  90.5  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
455 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 
453 aa  89.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
464 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
464 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  24.01 
 
 
440 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 
411 aa  86.7  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>