More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2244 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
440 aa  900    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  45.92 
 
 
438 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  38.28 
 
 
422 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  39.02 
 
 
421 aa  280  5e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  38.34 
 
 
433 aa  263  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 
411 aa  260  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  37.63 
 
 
411 aa  259  7e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  36.6 
 
 
411 aa  241  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 
414 aa  227  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 
413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  32.66 
 
 
437 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 
425 aa  217  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  32.8 
 
 
434 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  31.95 
 
 
423 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 
446 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 
447 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 
439 aa  202  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 
421 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 
436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  33.95 
 
 
419 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 
455 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.65 
 
 
418 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  31.48 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 
428 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  30.59 
 
 
426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 
428 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  29 
 
 
453 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
424 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 
412 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 
419 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 
466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
430 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 
423 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
421 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 
412 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  30.19 
 
 
412 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
425 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.98 
 
 
424 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
412 aa  156  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
420 aa  156  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 
415 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.57 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 
522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  28.84 
 
 
439 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 
420 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
423 aa  149  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 
418 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
421 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.03 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
444 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.53 
 
 
496 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 
419 aa  137  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 
412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 
439 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 
439 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
446 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
433 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 
363 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 
431 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
465 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.73 
 
 
452 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
465 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
465 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 
437 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
423 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 
410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 
416 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 
449 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
410 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  26.41 
 
 
400 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
424 aa  112  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
424 aa  113  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.2 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  25.77 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
464 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 
464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 
455 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 
455 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
455 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
436 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.76 
 
 
434 aa  107  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 
433 aa  107  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.77 
 
 
454 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 
483 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.54 
 
 
422 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
421 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
422 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 
430 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.43 
 
 
422 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>