More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1492 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
421 aa  859    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  60.53 
 
 
436 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.65 
 
 
407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
423 aa  133  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 
413 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.44 
 
 
410 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.23 
 
 
431 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.44 
 
 
410 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.62 
 
 
434 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
412 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 
440 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 
425 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 
428 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
411 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
411 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 
412 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.77 
 
 
440 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 
410 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  20.9 
 
 
439 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 
410 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 
461 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
415 aa  97.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
412 aa  96.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
424 aa  94.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 
414 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
466 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 
456 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
410 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 
410 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.76 
 
 
430 aa  90.1  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
429 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 
425 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
439 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 
418 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  24.42 
 
 
446 aa  86.3  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 
437 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.89 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
457 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 
410 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.05 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4695  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.52565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.26 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.16 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.47 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
436 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4716  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 
444 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.2 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7337  ABC transporter substrate binding protein  23.51 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00127436  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
473 aa  79.7  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  20.21 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.42 
 
 
430 aa  77  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 
430 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  23.65 
 
 
422 aa  77  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 
439 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 
439 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 
422 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.88 
 
 
496 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1410  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>