276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4871 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 434 aa  888    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3428  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 		 425 aa  293  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  39.38 
 
 		 418 aa  289  8e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  40.2 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 		 424 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0228  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 		 435 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6533  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0232  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7039  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3299  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 426 aa  167  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3847  extracellular solute-binding protein family 1  30.63 
 
 		 421 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00585532  normal  0.205792 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.39 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 415 aa  90.1  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 414 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 425 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.06 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.4 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 423 aa  67  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.72 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.72 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.75 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  21.88 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7337  ABC transporter substrate binding protein  23.35 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00127436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.35 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.17 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.19 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0034  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.75 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.79 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  20.7 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1459  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.37 
 
 		 457 aa  57  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.08 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  21.09 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  20.36 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>