206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3847 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3847  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 421 aa  852    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00585532  normal  0.205792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7039  extracellular solute-binding protein  47.26 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0232  extracellular solute-binding protein  49.13 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3299  extracellular solute-binding protein  46.46 
 
 		 421 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  39.31 
 
 		 441 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  36.8 
 
 		 418 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  35.41 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3428  extracellular solute-binding protein  36.75 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0228  extracellular solute-binding protein  34.17 
 
 		 435 aa  209  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6533  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  30.63 
 
 		 434 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.74 
 
 		 439 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.75 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.47 
 
 		 407 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.26 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1748  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3710  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00279907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  25.71 
 
 		 411 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  25.71 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1046  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  20.99 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.47 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  21.71 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  20.81 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.71 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 417 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  21.95 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1485  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3750  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.55 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0617  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  26.53 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  19.24 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  21.3 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0655  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  26.46 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.454035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>