More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0381 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
421 aa  858    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  34.1 
 
 
416 aa  222  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  34.1 
 
 
416 aa  222  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  32.42 
 
 
420 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 
435 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  30.98 
 
 
427 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  30.38 
 
 
425 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 
418 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.12 
 
 
430 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.18 
 
 
426 aa  173  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  30.79 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 
447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
434 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
417 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 
420 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  31.06 
 
 
448 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 
414 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  31.41 
 
 
504 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.41 
 
 
408 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 
422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 
420 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 
461 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 
442 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 
445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 
413 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.12 
 
 
407 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.86 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 
455 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
403 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.06 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.94 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 
503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
427 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 
479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
411 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 
417 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 
415 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 
443 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.66 
 
 
431 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
422 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 
413 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 
483 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 
422 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  30.55 
 
 
435 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
405 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
424 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
488 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
399 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
488 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.11 
 
 
410 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.11 
 
 
410 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 
429 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.6 
 
 
430 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
430 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
449 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 
406 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
454 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 
412 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 
510 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 
461 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 
430 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 
419 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.48 
 
 
439 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
424 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.12 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
429 aa  97.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
419 aa  96.7  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
443 aa  96.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
424 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  25.3 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  25.75 
 
 
440 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
456 aa  94  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 
410 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  25.19 
 
 
439 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3271  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 
473 aa  93.2  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
421 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.97 
 
 
453 aa  92.8  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 
424 aa  92.8  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.15 
 
 
434 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 
484 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 
424 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>