279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1773 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 465 aa  946    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 		 447 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  56.28 
 
 		 448 aa  481  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  48.83 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1639  extracellular solute-binding protein family 1  46.35 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.102178  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  44.95 
 
 		 434 aa  355  7.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  42.37 
 
 		 464 aa  350  3e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40 
 
 		 442 aa  289  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  33.57 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  29.35 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 435 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  28.57 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.6 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 453 aa  110  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.87 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  22.47 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 420 aa  93.2  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.77 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15060  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.14 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.06 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.76 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  32.34 
 
 		 442 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.06 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  22.44 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  33.14 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13860  maltose-binding periplasmic protein  26.57 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.71 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  30.11 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.21 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  29.93 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.72 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.13 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1291  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.88 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  20.08 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  31.48 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  29.5 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.89 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.91 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 424 aa  57  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  20.8 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  25.82 
 
 		 409 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.63 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11510  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.48 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>