More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0923 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  100 
 
 		 450 aa  914    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  61.67 
 
 		 447 aa  551  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  47.13 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  42.95 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  44.87 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  48.06 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  45.27 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  42.42 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  39.26 
 
 		 453 aa  320  5e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  30.09 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  29.93 
 
 		 434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  29.96 
 
 		 437 aa  173  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.03 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.19 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.58 
 
 		 431 aa  146  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  34.32 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  32.69 
 
 		 424 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  32.4 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 442 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 452 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 454 aa  120  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.68 
 
 		 438 aa  117  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 430 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  28.57 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  27.69 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  25.71 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.32 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 412 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.61 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.98 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.19 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  30.58 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.53 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  30.65 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  32.09 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  32.99 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>