229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0531 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 429 aa  870    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  46.05 
 
 		 424 aa  398  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  45.35 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  45.79 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  46.03 
 
 		 421 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  44.14 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  38.9 
 
 		 438 aa  310  4e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  32.53 
 
 		 455 aa  256  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  30.47 
 
 		 434 aa  162  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  28.78 
 
 		 442 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 424 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 424 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.81 
 
 		 447 aa  97.8  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  26.39 
 
 		 437 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 452 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.08 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 418 aa  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.85 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.3 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.95 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 432 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  28.09 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.59 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  26.13 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  25 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  23.5 
 
 		 437 aa  67  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 434 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.89 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.83 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.07 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.07 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  25.6 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.55 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  22.65 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.41 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  22.32 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3075  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 445 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  30.52 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.64 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.35 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 464 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 961 aa  54.3  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1392  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 449 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000859872  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.13 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 434 aa  53.9  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 448 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 449 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>