91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2399 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
433 aa  872    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  58.39 
 
 
430 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  54.01 
 
 
446 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  55.93 
 
 
438 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  55.43 
 
 
441 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  43.28 
 
 
424 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  37.66 
 
 
462 aa  256  6e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  40.2 
 
 
450 aa  252  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  40.36 
 
 
434 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  36.68 
 
 
432 aa  237  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  36.93 
 
 
435 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  36.52 
 
 
422 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  33.79 
 
 
438 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  37.89 
 
 
435 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
428 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.96 
 
 
450 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  32.11 
 
 
433 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  35.68 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  36.75 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  36.83 
 
 
433 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  33.93 
 
 
447 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 
452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 
452 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 
431 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 
430 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.15 
 
 
416 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
417 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
410 aa  96.3  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 
418 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  23.95 
 
 
437 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 
434 aa  79.7  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 
442 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 
445 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.17 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.19 
 
 
449 aa  70.1  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  28.7 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
421 aa  67  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.39 
 
 
450 aa  66.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
424 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
438 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.74 
 
 
444 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 
434 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  23.79 
 
 
437 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 
424 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
429 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.8 
 
 
458 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  31.87 
 
 
434 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 
480 aa  55.8  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 
415 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.7 
 
 
447 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 
446 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
424 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
444 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 
422 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 
457 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  39.05 
 
 
433 aa  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.57 
 
 
445 aa  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  21.57 
 
 
467 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.74 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 
411 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 
411 aa  47.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 
439 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
449 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 
450 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 
441 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  21.75 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 
445 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 
439 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
449 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 
430 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 
429 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 
422 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 
455 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.05 
 
 
426 aa  43.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>