More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1454 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 445 aa  888    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  34.44 
 
 		 449 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35.59 
 
 		 453 aa  253  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  33.41 
 
 		 438 aa  242  9e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  32.79 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  31.85 
 
 		 437 aa  216  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  33.49 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  29.83 
 
 		 456 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  30.36 
 
 		 439 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.26 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  30.07 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.73 
 
 		 445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.23 
 
 		 450 aa  183  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.75 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 480 aa  167  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  29.8 
 
 		 445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.15 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.82 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 442 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  30.16 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 410 aa  108  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  28.31 
 
 		 432 aa  107  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.6 
 
 		 450 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 429 aa  97.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 457 aa  96.7  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.71 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 415 aa  92.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.62 
 
 		 416 aa  90.1  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  25.37 
 
 		 433 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 421 aa  89.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.43 
 
 		 438 aa  88.2  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  24.49 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 456 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 504 aa  87  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  31.08 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.12 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  31.69 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.83 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.84 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.3 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.74 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.3 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>