More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01900 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 442 aa  885    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  37.74 
 
 		 434 aa  295  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  38.62 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  39.61 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  37.29 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1639  extracellular solute-binding protein family 1  35.75 
 
 		 463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.102178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.16 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  30.56 
 
 		 460 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.59 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  29.19 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.39 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.11 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  30.35 
 
 		 425 aa  113  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 		 435 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 421 aa  87.4  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.99 
 
 		 453 aa  86.7  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.99 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  32.52 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.17 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  26.94 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  34.59 
 
 		 450 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.43 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  25.83 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  32.26 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.46 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.47 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  26.36 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  36.21 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11510  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.67 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15060  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.35 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.57 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.8 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  30.26 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.5 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  23.13 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.08 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.71 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  32.84 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1686  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  22.09 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>