More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0427 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 497 aa  1025    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 		 487 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 447 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 414 aa  113  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  27.23 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  27.23 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  26.49 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.94 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  34.15 
 
 		 449 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 		 479 aa  100  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 415 aa  97.8  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 449 aa  93.6  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 422 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 460 aa  91.3  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3456  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 444 aa  90.5  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0015  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 470 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 467 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 503 aa  87  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  23.25 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29420  carbohydrate-binding protein  24.11 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.94 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.07 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.02 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.48 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  21.31 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2195  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4883  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.7 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134037  normal  0.0630481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  30.06 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2042  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305417  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  24.07 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 427 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 425 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 406 aa  67  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 445 aa  67  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  21.6 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.28 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0113  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.270734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.55 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  21.66 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.19 
 
 		 406 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0752  putative extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.7 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>