More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0354 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  78.52 
 
 		 419 aa  690    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 419 aa  855    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  79.24 
 
 		 419 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  82.58 
 
 		 420 aa  730    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  55.48 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  34.43 
 
 		 420 aa  229  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 425 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 446 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 404 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.84 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  31.03 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0186  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 432 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.82 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.14 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.9 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.15 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.18 
 
 		 434 aa  97.1  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 415 aa  97.1  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.99 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0063  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 475 aa  90.9  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.62 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.93 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 480 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 435 aa  86.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 426 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 426 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  22.58 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  21.77 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.88 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  38.26 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 408 aa  82.8  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.69 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.61 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2297  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  28.69 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>