More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5852 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  97.61 
 
 
419 aa  842    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  79.24 
 
 
419 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  79.71 
 
 
420 aa  702    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
419 aa  855    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  55.34 
 
 
419 aa  508  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  33.1 
 
 
420 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  31.41 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 
425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.47 
 
 
438 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
424 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 
446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  25.55 
 
 
404 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 
426 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 
427 aa  116  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  28.1 
 
 
440 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.88 
 
 
431 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25.9 
 
 
421 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
411 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
432 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.81 
 
 
411 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.81 
 
 
366 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
432 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
432 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
415 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  24.67 
 
 
426 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
399 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0186  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
397 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.98 
 
 
430 aa  99.8  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 
430 aa  98.2  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
410 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.27 
 
 
434 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.14 
 
 
428 aa  94  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
421 aa  93.6  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.77 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.8 
 
 
410 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.01 
 
 
438 aa  90.9  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 
406 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
421 aa  89.7  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
435 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 
415 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 
426 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 
426 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
455 aa  87.4  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.72 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.84 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
406 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.92 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 
466 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0063  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 
475 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
437 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
436 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 
438 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 
407 aa  79.7  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.32 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  29.69 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  28.35 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  25.63 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  23.95 
 
 
436 aa  77.4  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  25.63 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  26.6 
 
 
442 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.6 
 
 
442 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.6 
 
 
442 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>