More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3775 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
459 aa  926    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.96 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
411 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
410 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
424 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.97 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.12 
 
 
366 aa  117  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 
427 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
439 aa  106  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  31.06 
 
 
438 aa  106  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.18 
 
 
438 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 
430 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.64 
 
 
430 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  23.64 
 
 
430 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.64 
 
 
430 aa  104  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
430 aa  104  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.64 
 
 
430 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.41 
 
 
430 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
425 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 
425 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 
433 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
424 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.09 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
443 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 
423 aa  97.4  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 
411 aa  97.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
466 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 
446 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 
423 aa  94.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
421 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 
432 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0306  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 
473 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
432 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25 
 
 
421 aa  90.9  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
459 aa  90.1  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 
426 aa  89.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  27.62 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.16 
 
 
438 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
404 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.14 
 
 
427 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2297  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
422 aa  87  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
420 aa  87  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 
436 aa  87  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 
441 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 
430 aa  86.7  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 
432 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.4 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35.22 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1353  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 
434 aa  83.2  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.06 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  21.61 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.29 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.92 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  30.92 
 
 
447 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.5 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.79 
 
 
428 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1879  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.81 
 
 
426 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 
420 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.48 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.74 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 
445 aa  77.8  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  21.99 
 
 
433 aa  77  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  21.95 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0577  extracellular solute-binding protein  21.5 
 
 
440 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>