More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0116 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  99.76 
 
 		 420 aa  852    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 420 aa  853    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  36.86 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  34.61 
 
 		 407 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  34 
 
 		 432 aa  223  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  32.67 
 
 		 432 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  31.53 
 
 		 414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  31.81 
 
 		 421 aa  189  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  29.21 
 
 		 434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  28.29 
 
 		 435 aa  169  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.63 
 
 		 424 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.67 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.2 
 
 		 426 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  28.32 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  30.35 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 426 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.69 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.06 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.17 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.85 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.18 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.36 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.99 
 
 		 403 aa  99.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 456 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 410 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.02 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.01 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.05 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.05 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 419 aa  87.8  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 486 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 415 aa  87  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  30.97 
 
 		 433 aa  86.7  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 		 419 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 437 aa  86.3  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.85 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.37 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.01 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  22 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  26.78 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1068  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.501776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>