More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9091 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 422 aa  851    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  44.59 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  33.84 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7201  extracellular solute-binding protein family 1  36.02 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.08 
 
 		 425 aa  196  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  34 
 
 		 445 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7721  extracellular solute-binding protein family 1  34.45 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.98 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0234  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 		 412 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.497123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1045  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0733801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  30.58 
 
 		 427 aa  146  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  29.78 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  30.08 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 424 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.74 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  29.45 
 
 		 427 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  26.09 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.61 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.07 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  26.68 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 432 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 459 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  29.51 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.8 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 426 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 426 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  29.82 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.71 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 432 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 410 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.36 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  23.19 
 
 		 421 aa  97.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.2 
 
 		 426 aa  97.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 466 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.91 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 486 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  30.38 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  23.56 
 
 		 434 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 433 aa  89.7  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 439 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.85 
 
 		 438 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.44 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.81 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  24.86 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.81 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.29 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  36.88 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  32.84 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.28 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.31 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.29 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>