280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1045 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1045  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 488 aa  974    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0733801  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0234  extracellular solute-binding protein family 1  41.43 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.497123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.11 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  34.56 
 
 		 435 aa  202  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  30.47 
 
 		 426 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.67 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7201  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  28.47 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7721  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.1 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.85 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.13 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 424 aa  90.1  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 459 aa  86.7  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.14 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.93 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  22.12 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  28.28 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  20.6 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.81 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.44 
 
 		 427 aa  62  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  30.08 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  29.83 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  28.49 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.09 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.47 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.38 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 		 419 aa  57  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  21.61 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  21.29 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 961 aa  56.6  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7039  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 415 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 		 436 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  29.74 
 
 		 436 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 432 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  21.81 
 
 		 434 aa  53.9  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 441 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 450 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 424 aa  53.5  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  32.48 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  29.23 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  28.91 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  32.89 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>