More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7725 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 420 aa  847    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  53.9 
 
 		 424 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  30.46 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  30.26 
 
 		 443 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.26 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 445 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  29.7 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  30.98 
 
 		 426 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 427 aa  132  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 		 410 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.85 
 
 		 422 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7201  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  28.7 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 415 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0234  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.497123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  28.49 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1045  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0733801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.81 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 486 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  28.52 
 
 		 416 aa  96.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  26.17 
 
 		 434 aa  96.3  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 435 aa  96.3  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 428 aa  93.2  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 411 aa  90.1  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 411 aa  90.1  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 459 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  27.89 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 402 aa  89  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 456 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  27.18 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 417 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 423 aa  86.3  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.07 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.46 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.97 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.48 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.48 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.53 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0496  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1807  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.7 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.93 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.28 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.28 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.56 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>