More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0552 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 445 aa  893    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7721  extracellular solute-binding protein family 1  39.33 
 
 		 462 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  40.05 
 
 		 426 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  34.28 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7201  extracellular solute-binding protein family 1  34.2 
 
 		 447 aa  193  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0234  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.497123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.39 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1045  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 488 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0733801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 427 aa  124  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  30.27 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.11 
 
 		 425 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.2 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 423 aa  107  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 459 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.17 
 
 		 443 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 392 aa  89.7  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 391 aa  89.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 391 aa  89.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 392 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  30.51 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  28.67 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.15 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.25 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.47 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.54 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.54 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  30.91 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.45 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1478  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.38 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000417686  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  33.58 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.58 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.68 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  24.63 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  29.12 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3317  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000142443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  30.94 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3451  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.772574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>