More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3683 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 432 aa  878    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  57.49 
 
 		 441 aa  475  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  59.21 
 
 		 444 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  59.5 
 
 		 443 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  59.5 
 
 		 443 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  59.5 
 
 		 443 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 424 aa  209  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.82 
 
 		 422 aa  149  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.82 
 
 		 422 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 455 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 455 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 411 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 420 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 468 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 436 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 443 aa  113  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.51 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.53 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.53 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.53 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.53 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.53 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  30.53 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 421 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.86 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  29.86 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.6 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  27.63 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 441 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  27.08 
 
 		 464 aa  98.2  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  28.22 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  29.39 
 
 		 459 aa  97.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4400  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 433 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.51 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 422 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 436 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 397 aa  96.3  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 440 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 436 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  25.19 
 
 		 448 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.31 
 
 		 496 aa  93.2  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 436 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 436 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 484 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 435 aa  90.5  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 447 aa  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  27.27 
 
 		 441 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  24.24 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  24.87 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4379  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 411 aa  88.2  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 427 aa  88.2  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 437 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>