More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4682 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  96.17 
 
 		 496 aa  760    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 412 aa  819    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  95.87 
 
 		 439 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  97.33 
 
 		 446 aa  781    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  95.87 
 
 		 439 aa  769    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  95.87 
 
 		 412 aa  769    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  55.5 
 
 		 431 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  56.27 
 
 		 419 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4399  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 455 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0609802  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 437 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 437 aa  127  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 421 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.46 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.46 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  29.22 
 
 		 443 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  27.73 
 
 		 439 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.71 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  28.95 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  26.3 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3171  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 443 aa  109  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.4 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.63 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 436 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.8 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.1 
 
 		 452 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.75 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 464 aa  98.2  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 415 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 441 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 423 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0640  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 436 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 447 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 455 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 437 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 434 aa  96.3  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 436 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.6 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 447 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 424 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  25.45 
 
 		 439 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 440 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>