More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00780 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
411 aa  848    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 
424 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 
410 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.64 
 
 
410 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 
410 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 
410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 
401 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
411 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 
409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.55 
 
 
411 aa  163  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.93 
 
 
366 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
428 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
399 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
433 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  29.46 
 
 
407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 
504 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  29.95 
 
 
410 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  29.95 
 
 
410 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.76 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
411 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 
401 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
420 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
429 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  28.12 
 
 
434 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
432 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
410 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 
432 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
414 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 
460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 
414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 
406 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.25 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.54 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.9 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.14 
 
 
426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 
484 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
432 aa  116  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
417 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 
408 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
432 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
414 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 
413 aa  113  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
449 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
466 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.81 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 
503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 
435 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.24 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 
436 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 
400 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  27.7 
 
 
404 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.33 
 
 
440 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
404 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
391 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 
459 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
439 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
446 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
439 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
426 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
390 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
412 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.33 
 
 
496 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.17 
 
 
430 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
419 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
430 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 
430 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 
398 aa  107  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 
405 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 
421 aa  106  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 
424 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.54 
 
 
431 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
406 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
433 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>