More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0719 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
413 aa  842    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  30.67 
 
 
427 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 
504 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  32.45 
 
 
416 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  32.45 
 
 
416 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 
420 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.26 
 
 
422 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 
420 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 
460 aa  126  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
445 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 
414 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 
421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 
411 aa  116  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
442 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  31.45 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  26.11 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
417 aa  113  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
414 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 
429 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 
415 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.02 
 
 
426 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 
443 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
417 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 
488 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
427 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
443 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 
488 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 
450 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 
432 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
424 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
406 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
442 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 
425 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  29.53 
 
 
439 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
449 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.44 
 
 
406 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
901 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  30.06 
 
 
408 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 
454 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  27.47 
 
 
408 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
411 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
479 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
403 aa  100  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.76 
 
 
411 aa  99.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
436 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
432 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
393 aa  99.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 
445 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.43 
 
 
428 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
433 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 
447 aa  97.1  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 
449 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  29.45 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.49 
 
 
366 aa  96.3  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3152  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
970 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 
441 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 
435 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
461 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
434 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
437 aa  94.7  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 
444 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0126  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 
477 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
437 aa  94  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 
436 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.55 
 
 
440 aa  93.2  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.75 
 
 
419 aa  92.8  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
436 aa  92.8  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 
437 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 
411 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
433 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2663  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 
468 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 
420 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 
410 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
415 aa  90.9  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 
410 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.46 
 
 
431 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 
503 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 
925 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
413 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
456 aa  90.1  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 
448 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 
411 aa  89.7  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  28.41 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
467 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 
427 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
441 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
424 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>