More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2137 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 467 aa  969    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.85 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 442 aa  94  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 420 aa  91.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 514 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  21.49 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 422 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 410 aa  87  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.4 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  22.2 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 424 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.71 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.94 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.17 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.28 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.28 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.67 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  20.98 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  21.39 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01220  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.45 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.31 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.82 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2042  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305417  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.7 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.54 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.35 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  20.69 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.74 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.27 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  20.58 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.2 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>