More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4697 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
442 aa  896    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  41.96 
 
 
444 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  40.86 
 
 
436 aa  316  6e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  37.64 
 
 
432 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
461 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  30.5 
 
 
430 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
423 aa  136  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  29.8 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 
466 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  30.15 
 
 
410 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  29.26 
 
 
403 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.73 
 
 
407 aa  121  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  34.04 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 
413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  35.9 
 
 
418 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  28.87 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  34.16 
 
 
414 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
410 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  28.47 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.02 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.02 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.79 
 
 
410 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  28.52 
 
 
429 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
410 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
453 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 
436 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
415 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
419 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3703  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 
466 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104923  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.65 
 
 
416 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  27.05 
 
 
416 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
424 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 
426 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 
416 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 
425 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 
445 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
415 aa  99.8  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.78 
 
 
465 aa  99  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
443 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 
453 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.41 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
411 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 
504 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8464  extracellular solute-binding protein family 1  29.87 
 
 
481 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.635867  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 
410 aa  94.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 
429 aa  93.6  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.54 
 
 
452 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 
464 aa  92.8  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
455 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.59 
 
 
447 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
424 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.69 
 
 
426 aa  92.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.25 
 
 
430 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2744  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.54 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3726  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.54 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3209  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.54 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0248662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1760  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.54 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3697  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.66 
 
 
441 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2794  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.54 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
464 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
427 aa  90.9  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3755  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.66 
 
 
441 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
418 aa  90.1  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
433 aa  90.1  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.6 
 
 
419 aa  90.1  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3021  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.9 
 
 
441 aa  89.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
449 aa  89.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 
442 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  31 
 
 
466 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 
422 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 
431 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 
441 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 
414 aa  87  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0234  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  23.88 
 
 
439 aa  87  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.500336 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
420 aa  87  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
411 aa  87  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 
435 aa  86.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2712  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.49 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.290307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0395  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.49 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0374  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.49 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 
456 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3492  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.96 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  33.82 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.07 
 
 
411 aa  84  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0323  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.2 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839712 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2709  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.46 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>