More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2794 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0374  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  88.07 
 
 		 444 aa  808    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2744  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  100 
 
 		 441 aa  909    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2709  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  82.05 
 
 		 441 aa  762    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3726  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  100 
 
 		 441 aa  909    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268589  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3492  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  88.99 
 
 		 444 aa  815    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3021  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  98.19 
 
 		 441 aa  895    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0298  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  87.16 
 
 		 444 aa  805    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3655  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.52 
 
 		 439 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0448  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  82.5 
 
 		 441 aa  773    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2712  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  88.07 
 
 		 443 aa  808    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.290307  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0314  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  87.36 
 
 		 444 aa  805    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0323  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  87.59 
 
 		 444 aa  807    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839712 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0395  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  88.07 
 
 		 443 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3209  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  100 
 
 		 441 aa  909    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0248662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1760  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  100 
 
 		 441 aa  909    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3697  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  99.55 
 
 		 441 aa  905    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3755  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  99.77 
 
 		 441 aa  905    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2794  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  100 
 
 		 441 aa  909    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3509  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  81.59 
 
 		 441 aa  770    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.839022  normal  0.0272066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0234  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.45 
 
 		 439 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.500336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3962  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.52 
 
 		 439 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0256  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.52 
 
 		 439 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0125  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.3 
 
 		 444 aa  631  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  69.47 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  69.47 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3870  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.23 
 
 		 438 aa  628  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  69.47 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.47 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3928  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  66.74 
 
 		 438 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3826  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  66.97 
 
 		 438 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3748  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  66.74 
 
 		 438 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3732  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.57 
 
 		 438 aa  628  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3931  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.23 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.47 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3759  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  66.97 
 
 		 438 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3856  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  67.21 
 
 		 440 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.64819 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.47 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3869  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  66.97 
 
 		 438 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4045  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.01 
 
 		 439 aa  624  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.661181  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3861  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.66 
 
 		 439 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0117  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.82 
 
 		 444 aa  623  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1264  glycerol-3-phosphate-binding periplasmic lipoprotein signal peptide  60.18 
 
 		 438 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.400828  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1092  extracellular solute-binding protein family 1  62.92 
 
 		 438 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1185  extracellular solute-binding protein family 1  62.68 
 
 		 438 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2052  extracellular solute-binding protein  62.11 
 
 		 438 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1881  extracellular solute-binding protein family 1  59.09 
 
 		 445 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000340671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2173  extracellular solute-binding protein family 1  58.37 
 
 		 445 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00822083  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2055  extracellular solute-binding protein  58.43 
 
 		 436 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.822621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5465  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0862  extracellular solute-binding protein  55.53 
 
 		 437 aa  475  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0791  extracellular solute-binding protein family 1  55.53 
 
 		 437 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.721808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4134  extracellular solute-binding protein family 1  53.59 
 
 		 437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3650  extracellular solute-binding protein  54.11 
 
 		 436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.144474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1287  extracellular solute-binding protein  53.86 
 
 		 435 aa  458  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0604  extracellular solute-binding protein  52.66 
 
 		 433 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0857  extracellular solute-binding protein  53.14 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4449  extracellular solute-binding protein  54.37 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00843107  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3686  extracellular solute-binding protein  50.96 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0849  extracellular solute-binding protein  49.51 
 
 		 434 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0177782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2738  extracellular solute-binding protein  50.45 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.345118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1265  extracellular solute-binding protein family 1  50.71 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4664  extracellular solute-binding protein  51.2 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4373  extracellular solute-binding protein  50.97 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0714  ABC transporter substrate-binding protein  50.36 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0097  extracellular solute-binding protein  50.24 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0404  extracellular solute-binding protein  50.58 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1646  extracellular solute-binding protein  51.92 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0111  putative glycerol 3-phosphate transport protein, ugpB-like protein  51.8 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2014  sn-glycerol-3-phosphate-binding periplasmic protein ugpB precursor  49.09 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167012  hitchhiker  0.0071297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0060  extracellular solute-binding protein family 1  51.33 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0186  extracellular solute-binding protein  51.56 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5274  extracellular solute-binding protein family 1  50.24 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0646  extracellular solute-binding protein  51.08 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3750  extracellular solute-binding protein  48.27 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316129  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0655  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  47.55 
 
 		 433 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.454035  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3290  ABC glycerol-3-phosphate transporter, periplasmic binding protein, UgpB  50.72 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06396  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  49.88 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4022  extracellular solute-binding protein  50.72 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0617  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  47.32 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3710  extracellular solute-binding protein  49.02 
 
 		 431 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00279907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5204  extracellular solute-binding protein family 1  49.05 
 
 		 440 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.306263 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0349  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  46.46 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3285  hypothetical protein  49.14 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4190  extracellular solute-binding protein  49.03 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2093  glycerol-3-phosphate ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  45.78 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107678  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3282  extracellular solute-binding protein  46.14 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5587  extracellular solute-binding protein  45.41 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1155  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  39.71 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3003  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4001  extracellular solute-binding protein family 1  39.35 
 
 		 442 aa  319  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0354  ABC transporter substrate binding protein (sn-glycerol 3-phosphate)  39.43 
 
 		 432 aa  312  9e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2075  extracellular solute-binding protein  37.77 
 
 		 433 aa  296  7e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6261  extracellular solute-binding protein family 1  35.56 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689417 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2199  hypothetical protein  37.32 
 
 		 437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5507  ABC transporter substrate binding protein (glycerol 3-phosphate)  38.08 
 
 		 447 aa  282  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0724145  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2227  hypothetical protein  36.62 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2351  extracellular solute-binding protein family 1  34.84 
 
 		 435 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0456809  normal  0.0969201 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3119  extracellular solute-binding protein family 1  36.3 
 
 		 451 aa  246  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3391  extracellular solute-binding protein family 1  36.38 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  36.17 
 
 		 445 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>