252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5587 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5587  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
456 aa  940    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3282  extracellular solute-binding protein  67.46 
 
 
435 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0186  extracellular solute-binding protein  53.86 
 
 
441 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1265  extracellular solute-binding protein family 1  53.86 
 
 
446 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0646  extracellular solute-binding protein  53.14 
 
 
441 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0404  extracellular solute-binding protein  53.72 
 
 
438 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0060  extracellular solute-binding protein family 1  53.62 
 
 
442 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0111  putative glycerol 3-phosphate transport protein, ugpB-like protein  53.11 
 
 
438 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1646  extracellular solute-binding protein  53.48 
 
 
440 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4134  extracellular solute-binding protein family 1  46.62 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3650  extracellular solute-binding protein  46.86 
 
 
436 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.144474  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0857  extracellular solute-binding protein  46.14 
 
 
437 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2055  extracellular solute-binding protein  45.19 
 
 
436 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.822621  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1287  extracellular solute-binding protein  44.69 
 
 
435 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3509  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  45.78 
 
 
441 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.839022  normal  0.0272066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5465  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 
434 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355429  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0448  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  45.54 
 
 
441 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0862  extracellular solute-binding protein  43.1 
 
 
437 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0791  extracellular solute-binding protein family 1  43.1 
 
 
437 aa  378  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.721808  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2052  extracellular solute-binding protein  44.2 
 
 
438 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2709  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  44.5 
 
 
441 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1185  extracellular solute-binding protein family 1  43.48 
 
 
438 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276437  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1264  glycerol-3-phosphate-binding periplasmic lipoprotein signal peptide  43.72 
 
 
438 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.400828  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3655  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.86 
 
 
439 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4022  extracellular solute-binding protein  44.5 
 
 
431 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1092  extracellular solute-binding protein family 1  43.24 
 
 
438 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503452  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3710  extracellular solute-binding protein  43.45 
 
 
431 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00279907  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3962  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  43.09 
 
 
439 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0256  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  43.09 
 
 
439 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2744  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  45.41 
 
 
441 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3726  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  45.41 
 
 
441 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268589  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3290  ABC glycerol-3-phosphate transporter, periplasmic binding protein, UgpB  44.25 
 
 
431 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3686  extracellular solute-binding protein  41.76 
 
 
460 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3209  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  45.41 
 
 
441 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0248662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1760  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  45.41 
 
 
441 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3697  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  45.41 
 
 
441 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2794  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  45.41 
 
 
441 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2014  sn-glycerol-3-phosphate-binding periplasmic protein ugpB precursor  43.52 
 
 
433 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167012  hitchhiker  0.0071297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3021  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  45.17 
 
 
441 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2712  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  43.48 
 
 
443 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.290307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0395  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  43.48 
 
 
443 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3755  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  45.17 
 
 
441 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0125  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.99 
 
 
444 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0374  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  43.48 
 
 
444 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4664  extracellular solute-binding protein  40.83 
 
 
448 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0298  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  43.24 
 
 
444 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0314  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  43 
 
 
444 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0117  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  43.17 
 
 
444 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0323  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.75 
 
 
444 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4373  extracellular solute-binding protein  42.09 
 
 
437 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4045  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.23 
 
 
439 aa  358  8e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.661181  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3492  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.75 
 
 
444 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3285  hypothetical protein  43.49 
 
 
431 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0714  ABC transporter substrate-binding protein  41.27 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3861  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.23 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0655  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  41.27 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.454035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3732  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.58 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5274  extracellular solute-binding protein family 1  40.94 
 
 
442 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3856  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.33 
 
 
440 aa  356  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.64819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0097  extracellular solute-binding protein  41.3 
 
 
434 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  42.34 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  42.34 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  42.34 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.34 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.34 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4190  extracellular solute-binding protein  42.49 
 
 
431 aa  354  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.34 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3870  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.34 
 
 
438 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4449  extracellular solute-binding protein  41.36 
 
 
446 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00843107  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3931  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.11 
 
 
438 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0617  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  41.27 
 
 
444 aa  353  5e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0849  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 
434 aa  352  7e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0177782  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0234  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.45 
 
 
439 aa  352  8.999999999999999e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.500336 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3750  extracellular solute-binding protein  40.81 
 
 
433 aa  352  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316129  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3826  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.03 
 
 
438 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3869  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.03 
 
 
438 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3759  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.03 
 
 
438 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0604  extracellular solute-binding protein  42.26 
 
 
433 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3928  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  42.03 
 
 
438 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3748  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  41.79 
 
 
438 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5204  extracellular solute-binding protein family 1  38.86 
 
 
440 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2738  extracellular solute-binding protein  40.34 
 
 
438 aa  335  9e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.345118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1881  extracellular solute-binding protein family 1  39.62 
 
 
445 aa  322  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000340671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2173  extracellular solute-binding protein family 1  39.39 
 
 
445 aa  322  9.000000000000001e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00822083  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0349  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  36.21 
 
 
441 aa  310  4e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06396  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  40.14 
 
 
435 aa  307  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2093  glycerol-3-phosphate ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  36.41 
 
 
435 aa  306  6e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107678  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3003  extracellular solute-binding protein  35.7 
 
 
442 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6261  extracellular solute-binding protein family 1  35.68 
 
 
428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.689417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4001  extracellular solute-binding protein family 1  34.74 
 
 
442 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131149  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2075  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
433 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1155  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  30.88 
 
 
434 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2199  hypothetical protein  32.77 
 
 
437 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5507  ABC transporter substrate binding protein (glycerol 3-phosphate)  31.51 
 
 
447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0724145  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2227  hypothetical protein  32.45 
 
 
437 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2351  extracellular solute-binding protein family 1  33.65 
 
 
435 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0456809  normal  0.0969201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0354  ABC transporter substrate binding protein (sn-glycerol 3-phosphate)  28.6 
 
 
432 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3119  extracellular solute-binding protein family 1  31.79 
 
 
451 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3391  extracellular solute-binding protein family 1  31.4 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0664  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  30.84 
 
 
478 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>