More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4767 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0374  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.79 
 
 		 444 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  100 
 
 		 438 aa  910    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 438 aa  910    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0125  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  84.65 
 
 		 444 aa  772    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0117  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  83.49 
 
 		 444 aa  763    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4045  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  81.57 
 
 		 439 aa  742    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.661181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3962  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  80.41 
 
 		 439 aa  746    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3492  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.11 
 
 		 444 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3861  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  82.03 
 
 		 439 aa  742    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3021  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.14 
 
 		 441 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3931  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  99.77 
 
 		 438 aa  909    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3732  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  99.09 
 
 		 438 aa  901    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0448  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.65 
 
 		 441 aa  634    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3655  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  80.18 
 
 		 439 aa  744    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0234  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  80.18 
 
 		 439 aa  739    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.500336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2712  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.56 
 
 		 443 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.290307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0256  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  80.41 
 
 		 439 aa  746    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0314  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.25 
 
 		 444 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3826  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  91.32 
 
 		 438 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  100 
 
 		 438 aa  910    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3928  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  91.1 
 
 		 438 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0298  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.02 
 
 		 444 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0395  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.56 
 
 		 443 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3870  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  99.54 
 
 		 438 aa  906    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3748  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  91.32 
 
 		 438 aa  840    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3856  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  89.04 
 
 		 440 aa  822    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.64819 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0323  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  69.25 
 
 		 444 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839712 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  910    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3759  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  91.32 
 
 		 438 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3869  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  91.32 
 
 		 438 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3509  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.65 
 
 		 441 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.839022  normal  0.0272066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  100 
 
 		 438 aa  910    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  100 
 
 		 438 aa  910    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2744  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.45 
 
 		 441 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3726  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.45 
 
 		 441 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268589  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2709  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  67.89 
 
 		 441 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3209  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.45 
 
 		 441 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0248662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1760  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.45 
 
 		 441 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3697  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.21 
 
 		 441 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3755  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.45 
 
 		 441 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2794  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  68.45 
 
 		 441 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2173  extracellular solute-binding protein family 1  62.68 
 
 		 445 aa  561  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00822083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1881  extracellular solute-binding protein family 1  62.44 
 
 		 445 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000340671  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1092  extracellular solute-binding protein family 1  61.72 
 
 		 438 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1185  extracellular solute-binding protein family 1  61.48 
 
 		 438 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1264  glycerol-3-phosphate-binding periplasmic lipoprotein signal peptide  58.93 
 
 		 438 aa  529  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.400828  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2052  extracellular solute-binding protein  58.74 
 
 		 438 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2055  extracellular solute-binding protein  59.67 
 
 		 436 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.822621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5465  extracellular solute-binding protein  55.16 
 
 		 434 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0604  extracellular solute-binding protein  53.74 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3686  extracellular solute-binding protein  49.88 
 
 		 460 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4664  extracellular solute-binding protein  49.77 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4134  extracellular solute-binding protein family 1  53.22 
 
 		 437 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2014  sn-glycerol-3-phosphate-binding periplasmic protein ugpB precursor  50.68 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167012  hitchhiker  0.0071297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1265  extracellular solute-binding protein family 1  52.01 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1287  extracellular solute-binding protein  53.59 
 
 		 435 aa  441  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4373  extracellular solute-binding protein  49.76 
 
 		 437 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3650  extracellular solute-binding protein  52.52 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.144474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0714  ABC transporter substrate-binding protein  49.76 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5274  extracellular solute-binding protein family 1  48.48 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0097  extracellular solute-binding protein  49.28 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1646  extracellular solute-binding protein  52.59 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0862  extracellular solute-binding protein  52.74 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0791  extracellular solute-binding protein family 1  52.51 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.721808  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4449  extracellular solute-binding protein  51.44 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00843107  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0857  extracellular solute-binding protein  52.87 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2738  extracellular solute-binding protein  49.31 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.345118  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0349  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  47.73 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0849  extracellular solute-binding protein  49.03 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0177782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0111  putative glycerol 3-phosphate transport protein, ugpB-like protein  52.27 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0404  extracellular solute-binding protein  49.65 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06396  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  51.07 
 
 		 435 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2093  glycerol-3-phosphate ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  47.91 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107678  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0060  extracellular solute-binding protein family 1  51.33 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0646  extracellular solute-binding protein  50.36 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0186  extracellular solute-binding protein  50.6 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4022  extracellular solute-binding protein  48.48 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5204  extracellular solute-binding protein family 1  47.05 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.306263 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3290  ABC glycerol-3-phosphate transporter, periplasmic binding protein, UgpB  48.48 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0655  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  47.64 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.454035  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3750  extracellular solute-binding protein  46.6 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316129  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3710  extracellular solute-binding protein  45.56 
 
 		 431 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00279907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0617  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  46.93 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4190  extracellular solute-binding protein  45.83 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3285  hypothetical protein  46.7 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3282  extracellular solute-binding protein  44.5 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5587  extracellular solute-binding protein  42.34 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1155  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  40.53 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3003  extracellular solute-binding protein  38.55 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2075  extracellular solute-binding protein  38.93 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4001  extracellular solute-binding protein family 1  37.96 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131149  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6261  extracellular solute-binding protein family 1  37.06 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0354  ABC transporter substrate binding protein (sn-glycerol 3-phosphate)  38.22 
 
 		 432 aa  282  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5507  ABC transporter substrate binding protein (glycerol 3-phosphate)  35.84 
 
 		 447 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0724145  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2199  hypothetical protein  36.89 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2227  hypothetical protein  36.74 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3391  extracellular solute-binding protein family 1  37.24 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3119  extracellular solute-binding protein family 1  37.65 
 
 		 451 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2351  extracellular solute-binding protein family 1  36.15 
 
 		 435 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0456809  normal  0.0969201 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2662  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.377519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>