More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0203 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
441 aa  891    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  43.98 
 
 
447 aa  355  6.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  40.1 
 
 
449 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
437 aa  193  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  29.59 
 
 
487 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  30.37 
 
 
497 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 
415 aa  170  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 
434 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
415 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 
415 aa  152  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
424 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  27.84 
 
 
462 aa  150  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  29.34 
 
 
455 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 
451 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.17 
 
 
407 aa  136  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0015  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 
457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 
421 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 
441 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 
415 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.98 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29420  carbohydrate-binding protein  28.25 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 
451 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
423 aa  124  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 
456 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.63 
 
 
410 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.63 
 
 
410 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0752  putative extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
439 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31197  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 
432 aa  117  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3456  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 
444 aa  116  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.96 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 
435 aa  110  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.75 
 
 
427 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
419 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 
422 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 
399 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 
430 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 
425 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.4 
 
 
422 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 
418 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
414 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 
435 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.3 
 
 
431 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 
405 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.36 
 
 
406 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.18 
 
 
416 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.94 
 
 
416 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 
444 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
410 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 
426 aa  97.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
438 aa  96.7  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 
433 aa  96.3  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.63 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 
450 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
433 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  23.92 
 
 
425 aa  94  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
433 aa  93.6  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
430 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 
436 aa  93.6  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
437 aa  93.2  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 
448 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4566  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 
453 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
421 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 
445 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  28.23 
 
 
403 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.33 
 
 
416 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
413 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
424 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 
455 aa  90.5  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.43 
 
 
427 aa  90.1  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
414 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.67 
 
 
426 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 
410 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 
420 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 
425 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 
423 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 
424 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
466 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  24.19 
 
 
448 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 
459 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
406 aa  87.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  31.68 
 
 
458 aa  87.4  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2195  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 
450 aa  86.7  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
415 aa  86.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
424 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 
410 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.78 
 
 
426 aa  86.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>