More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2588 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 419 aa  853    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  55.61 
 
 		 415 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  42.29 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  43.46 
 
 		 414 aa  324  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 453 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 461 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.73 
 
 		 419 aa  89.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.93 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 422 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.6 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.26 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.24 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.63 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 503 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  28.73 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.27 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2662  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.377519  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.97 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  25.42 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.36 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  21.75 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.81 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.27 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.07 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>