69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2263 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 441 aa  887    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0015  extracellular solute-binding protein family 1  44.93 
 
 		 470 aa  363  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  44.52 
 
 		 451 aa  354  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29420  carbohydrate-binding protein  43.28 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  40.65 
 
 		 462 aa  331  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  40.29 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0752  putative extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 439 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.33 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  30.57 
 
 		 455 aa  193  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 441 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 		 447 aa  99.8  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 437 aa  96.3  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  22.86 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3456  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  23.1 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  21.31 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.55 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 432 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.33 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  23.58 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  20.14 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.39 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.59 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  21.61 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3317  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000142443  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  22.13 
 
 		 408 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 479 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.99 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.21 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  21.69 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  24.79 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  29.59 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 447 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>