More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4344 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 428 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  94.86 
 
 		 428 aa  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  68.46 
 
 		 428 aa  623  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  51.04 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  41.44 
 
 		 428 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  41.81 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 		 428 aa  299  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  31.96 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  32.05 
 
 		 450 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  32.7 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  30.17 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.4 
 
 		 450 aa  210  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.42 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  34.76 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  33.26 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  31.93 
 
 		 441 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  33.97 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  30.36 
 
 		 442 aa  201  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  32.86 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  31.07 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 		 437 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 		 422 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.36 
 
 		 416 aa  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  28.78 
 
 		 428 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  30.75 
 
 		 441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 427 aa  166  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.86 
 
 		 437 aa  156  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.42 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 458 aa  126  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  21.93 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  21.93 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 451 aa  94  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 432 aa  86.3  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.41 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.41 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.31 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.8 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  20.88 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.81 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.86 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>