288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0748 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 453 aa  929    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  47.32 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  43.93 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3456  extracellular solute-binding protein  40.14 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  27.98 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  24.94 
 
 		 462 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 451 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0015  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 470 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0752  putative extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.69 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29420  carbohydrate-binding protein  26.27 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.3 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  21.59 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  20.82 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  21.66 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  32 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  21.87 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25.33 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  21.88 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  22.09 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 429 aa  57  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  23.6 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.6 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  24.92 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.57 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  40.26 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  32.97 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.62 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  24.02 
 
 		 420 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 414 aa  54.7  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 449 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.17 
 
 		 415 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0021  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.45 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 		 453 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  19.74 
 
 		 399 aa  54.3  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  24.26 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.94 
 
 		 463 aa  53.9  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  24.26 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  32.77 
 
 		 450 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 427 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>