More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0825 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  79.21 
 
 		 430 aa  727    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 429 aa  881    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  54.08 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  53.15 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  52.21 
 
 		 429 aa  471  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  52.21 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  51.4 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  51.4 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  51.4 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  49.53 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  46.99 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  48.96 
 
 		 439 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  49.28 
 
 		 451 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  36.22 
 
 		 433 aa  292  7e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  37.95 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  35.9 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  34.77 
 
 		 430 aa  265  8.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  35.17 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  29.81 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 428 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.02 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.11 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.08 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  26.39 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 451 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 453 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 422 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  21.53 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 428 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  23.75 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 432 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 450 aa  93.2  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.87 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  31.33 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.06 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.97 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.72 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.41 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.68 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  35.48 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 419 aa  67  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.39 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  33.11 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.13 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.08 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  26.11 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  23.14 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  21.16 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>