More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2614 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 461 aa  954    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 415 aa  133  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 422 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 417 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 421 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 423 aa  94  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 444 aa  90.5  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.47 
 
 		 410 aa  90.5  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.94 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  20.22 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.83 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 419 aa  87.8  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 461 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 410 aa  87  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.67 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.6 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.78 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.93 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.64 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.88 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.7 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  20.81 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  21.46 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.51 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  21.39 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  21.24 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.24 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.4 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  23.46 
 
 		 448 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  19.79 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>