More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3982 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 435 aa  870    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  44.34 
 
 		 425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  28.41 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.36 
 
 		 416 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 412 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 432 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 445 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  26.1 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  27.4 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 459 aa  86.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.45 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  26.61 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  25 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  26.78 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.28 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  25.38 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  26.3 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  32.65 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  24.94 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.8 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  21.58 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.38 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  28.47 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 		 433 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5331  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.76 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.13 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2982  trehalose/maltose binding protein  30.28 
 
 		 281 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  29.93 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.52 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.96 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.73 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0900  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0889  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0942  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.254009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>