More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3337 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 427 aa  855    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  43.28 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  32.24 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  32.11 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.65 
 
 		 420 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  30.9 
 
 		 426 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.22 
 
 		 443 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.86 
 
 		 422 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.66 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 424 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  34.58 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7201  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  27.1 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  29.61 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  26.7 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 402 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 430 aa  109  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 459 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 504 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.02 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1045  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0733801  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.07 
 
 		 411 aa  99.8  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0234  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.497123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 415 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.4 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.7 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  30.61 
 
 		 470 aa  93.2  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 422 aa  90.1  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.44 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 439 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.65 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  24.31 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  30.09 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7721  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  22.73 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.7 
 
 		 444 aa  79.7  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  22.73 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  31.61 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.27 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.07 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01810  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.03 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>