More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0514 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
426 aa  850    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  66.01 
 
 
424 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  53.19 
 
 
428 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  50.74 
 
 
427 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  38.64 
 
 
399 aa  271  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  31.53 
 
 
446 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
430 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  31.83 
 
 
440 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  30.82 
 
 
430 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  32.41 
 
 
434 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 
422 aa  194  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
459 aa  153  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.83 
 
 
430 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 
486 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.23 
 
 
411 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  30.17 
 
 
431 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
411 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.36 
 
 
366 aa  133  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.46 
 
 
420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.22 
 
 
410 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.09 
 
 
426 aa  126  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
413 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.79 
 
 
407 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 
430 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  31.67 
 
 
424 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 
410 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  27.41 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.94 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 
419 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 
419 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
420 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 
443 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  28.54 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.31 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 
424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  28.54 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
425 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
429 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 
450 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
423 aa  113  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
411 aa  112  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 
425 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
436 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.51 
 
 
406 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
466 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
428 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
425 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
419 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
411 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
411 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
455 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
411 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
461 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
423 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
439 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
432 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
415 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
504 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 
419 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
414 aa  100  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
424 aa  99.8  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
410 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 
412 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 
416 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
464 aa  97.4  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
432 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
405 aa  97.1  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 
447 aa  96.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 
442 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
436 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 
440 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
415 aa  94.7  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
452 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  21.73 
 
 
421 aa  93.6  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
431 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 
436 aa  93.2  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 
430 aa  93.2  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
412 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 
415 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 
441 aa  93.2  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
419 aa  93.2  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
419 aa  93.2  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 
441 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.55 
 
 
403 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 
433 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 
425 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 
397 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>