More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1846 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 425 aa  871    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  61.99 
 
 		 436 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  52.55 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 		 419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  30.09 
 
 		 419 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  30.86 
 
 		 404 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 419 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0186  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.86 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  28.95 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.2 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 459 aa  109  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  27.74 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 504 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.63 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.68 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  32.84 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 433 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 420 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 441 aa  96.3  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  28.77 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.14 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 466 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 444 aa  92.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 446 aa  89.7  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 399 aa  87.8  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.17 
 
 		 407 aa  87.8  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 437 aa  87.8  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 439 aa  87  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 414 aa  87  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 434 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.23 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.79 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.44 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0942  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.254009  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.25 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2663  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 468 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.79 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.88 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>