More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0753 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
437 aa  899    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  68.88 
 
 
436 aa  630  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  59.91 
 
 
437 aa  570  1e-161  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  59.45 
 
 
437 aa  561  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0332  extracellular solute-binding protein family 1  40.95 
 
 
468 aa  330  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  41.35 
 
 
437 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  38.93 
 
 
445 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  39.91 
 
 
439 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4733  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  39.47 
 
 
458 aa  296  7e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0538  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  39.23 
 
 
458 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0569  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  39.23 
 
 
458 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  38.72 
 
 
458 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0625  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  38.48 
 
 
458 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0606  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  38.98 
 
 
458 aa  292  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0483  extracellular solute-binding protein  38.98 
 
 
458 aa  292  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0482  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  38.48 
 
 
458 aa  292  9e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0632  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein, putative  38.5 
 
 
458 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0700  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  38.98 
 
 
458 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0322  extracellular solute-binding protein family 1  36.45 
 
 
435 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2662  extracellular solute-binding protein  36.87 
 
 
433 aa  286  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.377519  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.45 
 
 
833 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0891124 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  32.7 
 
 
462 aa  230  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0374  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  32.04 
 
 
444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2712  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  32.04 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.290307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0395  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  32.04 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3509  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  32.64 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.839022  normal  0.0272066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1264  glycerol-3-phosphate-binding periplasmic lipoprotein signal peptide  32.13 
 
 
438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.400828  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3931  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.83 
 
 
438 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0448  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  32.18 
 
 
441 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  31.59 
 
 
438 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  31.59 
 
 
438 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2709  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  33.02 
 
 
441 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.59 
 
 
438 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.59 
 
 
438 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0349  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  29.95 
 
 
441 aa  212  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  31.59 
 
 
438 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.59 
 
 
438 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0298  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.72 
 
 
444 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3870  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.59 
 
 
438 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0097  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 
434 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3697  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.54 
 
 
441 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4022  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
431 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2744  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.54 
 
 
441 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3726  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.54 
 
 
441 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268589  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3290  ABC glycerol-3-phosphate transporter, periplasmic binding protein, UgpB  31.15 
 
 
431 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3021  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  32.01 
 
 
441 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2093  glycerol-3-phosphate ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  32.48 
 
 
435 aa  210  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107678  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3209  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.54 
 
 
441 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0248662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1760  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.54 
 
 
441 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2794  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.54 
 
 
441 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3732  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.21 
 
 
438 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3755  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.54 
 
 
441 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1092  extracellular solute-binding protein family 1  32.09 
 
 
438 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503452  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3492  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30.8 
 
 
444 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0323  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.49 
 
 
444 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0314  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  31.49 
 
 
444 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1185  extracellular solute-binding protein family 1  31.86 
 
 
438 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276437  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3826  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30.98 
 
 
438 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3759  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30.98 
 
 
438 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3869  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30.98 
 
 
438 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3928  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30.98 
 
 
438 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0604  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 
433 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3285  hypothetical protein  31.64 
 
 
431 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0849  extracellular solute-binding protein  32.15 
 
 
434 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0177782  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0125  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30.32 
 
 
444 aa  203  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3748  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30.75 
 
 
438 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5274  extracellular solute-binding protein family 1  31.59 
 
 
442 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2052  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 
438 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06396  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  33.26 
 
 
435 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3686  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 
460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3962  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30.88 
 
 
439 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0256  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30.88 
 
 
439 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4190  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 
431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5204  extracellular solute-binding protein family 1  30.93 
 
 
440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0117  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  29.79 
 
 
444 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3655  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30.64 
 
 
439 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3856  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30.11 
 
 
440 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.64819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4045  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30.9 
 
 
439 aa  196  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.661181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4373  extracellular solute-binding protein  31 
 
 
437 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3750  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 
433 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0234  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  29.26 
 
 
439 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.500336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4449  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 
446 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00843107  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1265  extracellular solute-binding protein family 1  30.16 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2738  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.345118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0862  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 
437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0655  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  29.11 
 
 
433 aa  190  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.454035  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 
425 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0791  extracellular solute-binding protein family 1  31.31 
 
 
437 aa  189  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.721808  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2014  sn-glycerol-3-phosphate-binding periplasmic protein ugpB precursor  28.99 
 
 
433 aa  189  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167012  hitchhiker  0.0071297 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3710  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
431 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00279907  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3003  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 
442 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3861  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  29.83 
 
 
439 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3282  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 
435 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0714  ABC transporter substrate-binding protein  29 
 
 
429 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5465  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 
434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355429  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1646  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 
440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
431 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0646  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 
441 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0617  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  28.64 
 
 
444 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0404  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
438 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>