More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0450 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
414 aa  844    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  71.74 
 
 
411 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  71.5 
 
 
411 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  69.9 
 
 
411 aa  588  1e-167  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  59.09 
 
 
413 aa  488  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  45.48 
 
 
428 aa  316  5e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 
421 aa  312  7.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  44.13 
 
 
437 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  38.07 
 
 
412 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  39.34 
 
 
430 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  41.54 
 
 
439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  39.3 
 
 
425 aa  286  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  39.21 
 
 
423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  40.8 
 
 
423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  39.15 
 
 
422 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
419 aa  275  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  37.27 
 
 
424 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  40.63 
 
 
423 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  38.88 
 
 
421 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  40.05 
 
 
439 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 
424 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  38.86 
 
 
455 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  40.84 
 
 
425 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  40.21 
 
 
421 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  37.19 
 
 
522 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 
436 aa  242  7.999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  37.24 
 
 
446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  40.25 
 
 
464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  39.1 
 
 
466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  32.78 
 
 
440 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  35.39 
 
 
418 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  37.56 
 
 
419 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  37.98 
 
 
447 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  32.86 
 
 
421 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  34.9 
 
 
438 aa  212  7.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  31.59 
 
 
419 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 
453 aa  206  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  35.88 
 
 
421 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  34.44 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  32.55 
 
 
422 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 
412 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  34.59 
 
 
412 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 
428 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  34.77 
 
 
412 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.13 
 
 
418 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  31.83 
 
 
434 aa  186  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  32.32 
 
 
433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  31.83 
 
 
426 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 
416 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 
437 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 
444 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
363 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  32.45 
 
 
449 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 
438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.17 
 
 
439 aa  147  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.17 
 
 
439 aa  146  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 
419 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.76 
 
 
496 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
412 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 
439 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
412 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 
431 aa  135  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
448 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  30.09 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.31 
 
 
402 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 
440 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 
448 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 
420 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
424 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  29.95 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  31.08 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 
419 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 
416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  30.46 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 
514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 
441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
477 aa  110  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.45 
 
 
410 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.45 
 
 
410 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
424 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
433 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.87 
 
 
407 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
429 aa  106  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  29.19 
 
 
435 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.5 
 
 
426 aa  106  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 
453 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>