More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1408 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  100 
 
 		 421 aa  851    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  63.29 
 
 		 433 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  56.32 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  41.65 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  39.02 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 		 428 aa  235  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  34.89 
 
 		 411 aa  221  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 411 aa  220  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  35.88 
 
 		 414 aa  210  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 411 aa  209  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  33.24 
 
 		 421 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 425 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 439 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  31.93 
 
 		 464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  32.26 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  30.75 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  32.14 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  30.94 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 423 aa  160  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 422 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  31.27 
 
 		 439 aa  156  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 		 423 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  33.24 
 
 		 522 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  36.92 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 426 aa  146  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 412 aa  146  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  27.29 
 
 		 430 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.18 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  32.86 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.43 
 
 		 421 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  32.81 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.35 
 
 		 496 aa  123  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 431 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 433 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 444 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.05 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  26.93 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.42 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 437 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.62 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  29.1 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.56 
 
 		 521 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.54 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4399  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 455 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0609802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 435 aa  87  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 483 aa  86.7  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.56 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 511 aa  83.2  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.78 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.44 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>